Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Spatc1Q148B6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spatc1Q148B6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Spatc1Q148B6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Spatc1Q148B6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Spatc1Q148B6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Spatc1Q148B6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms