Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VgfQ0VGU4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms