Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli2Q0VGT2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gli2Q0VGT2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms