Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc162pQ0VG85 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms