Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tigd2Q0VBL1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd2Q0VBL1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms