Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r181Q0P547 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r181Q0P547 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms