Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc21bQ0HA38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms