Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnnm1Q0GA42 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms