Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcnt1Q09324 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcnt1Q09324 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms