Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc4Q08624 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc4Q08624 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms