Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4CQ08493 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms