Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms