Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CbfbQ08024 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms