Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms