Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atf4Q06507 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf4Q06507 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms