Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPINDOCQ05AH6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPINDOCQ05AH6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPINDOCQ05AH6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINDOCQ05AH6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPINDOCQ05AH6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms