Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fmn1Q05860 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms