Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc2Q05020 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc2Q05020 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms