Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sox12Q04890 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms