Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Top1Q04750 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top1Q04750 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top1Q04750 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top1Q04750 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top1Q04750 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms