Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk16Q04735 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms