Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crisp1Q03401 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms