Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Runx1Q03347 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Runx1Q03347 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Runx1Q03347 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Runx1Q03347 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Runx1Q03347 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Runx1Q03347 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Runx1Q03347 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Runx1Q03347 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Runx1Q03347 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Runx1Q03347 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Runx1Q03347 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms