Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb5Q02739 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms