Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms