Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms