Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rsu1Q01730 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsu1Q01730 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms