Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HmgcrQ01237 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms