Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms