Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb2Q00977 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb2Q00977 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms