Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SeleQ00690 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms