Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabpaQ00422 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms