Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbp10Q000W5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms