Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab33aP97950 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab33aP97950 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms