Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms