Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc1P97496 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms