Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Npas1P97459 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms