Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis3P97368 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis3P97368 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis3P97368 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Meis3P97368 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis3P97368 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis3P97368 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis3P97368 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis3P97368 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms