Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx2-3P97334 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms