Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrp1P97333 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrp1P97333 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nrp1P97333 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrp1P97333 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms