Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vgll3P85442 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vgll3P85442 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms