Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tp53bp1P70399 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53bp1P70399 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms