Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ufd1P70362 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms