Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcm1P70348 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcm1P70348 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms