Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta1P68134 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta1P68134 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta1P68134 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms