Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms