Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtnP63089 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtnP63089 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtnP63089 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtnP63089 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtnP63089 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtnP63089 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtnP63089 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtnP63089 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtnP63089 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtnP63089 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtnP63089 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtnP63089 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtnP63089 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtnP63089 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtnP63089 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtnP63089 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtnP63089 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtnP63089 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtnP63089 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtnP63089 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtnP63089 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtnP63089 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtnP63089 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms