Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabrb3P63080 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabrb3P63080 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms