Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp2P63044 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp2P63044 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms