Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rps3P62908 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rps3P62908 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3P62908 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3P62908 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps3P62908 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps3P62908 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3P62908 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms